За да ги постигне целите и мисијата на компанијата, управата на Крка се потпира на решителност, одговорност и јасна визија во своето раководење со вработените. Кон сложените деловни процеси се пристапува на транспарентен начин, кое бара блиска и интензивна соработка на вработените.

Корпоративното управување на Крка се заснова на систем на две нивоа. Управниот одбор раководи со компанијата, а Надзорниот одбор ја контролира работата на Управниот одбор. Корпоративното управување се заснова на законодавството на Република Словенија, словенечката и меѓународната добра практика, јавно достапната Политика за корпоративно управување на компанијата и нејзините внатрешни правила.